Combiner CellProfiler avec ImageJ pour une analyse combinée
Vos biologistes en recherche étendent leur pratique du thème CellProfiler à un sujet complémentaire ou à une tendance, avec des cas concrets.
En bref
- Résultat
- Vos biologistes en recherche étendent leur pratique du thème CellProfiler à un sujet complémentaire ou à une tendance, avec des cas concrets.
- Idéal pour
- Praticiens du thème CellProfiler qui veulent combiner CellProfiler avec ImageJ pour une analyse combinée.
- Objectifs pédagogiques
- Vous saurez : combiner CellProfiler avec ImageJ pour une analyse combinée ; analyser des images cellulaires avec CellProfiler ; automatiser le traitement d'images biologiques avec CellProfiler ; maîtriser CellProfiler pour automatiser l'analyse d'images cellulaires.
- Livrables
- Programme du niveau, support de session, évaluation des acquis et attestation détaillée par participant.
- Prérequis
- Niveau 2 acquis ou pratique régulière du sujet ; positionnement par questionnaire.
- Durée
- 1 à 2 jours
- Tarif
- À partir de 1 112 € HT par jour.

Dans quelle situation
Une équipe maîtrise le thème CellProfiler et veut combiner CellProfiler avec ImageJ pour une analyse combinée. La session dédiée traite ce sujet en profondeur, sans refaire les bases.
Cette session spécifique étend le thème CellProfiler à un sujet complémentaire : combiner CellProfiler avec ImageJ pour une analyse combinée, dans les laboratoires de recherche et sur les sites industriels, où la fiabilité des analyses, la reproductibilité des résultats et l'encadrement des usages de l'IA engagent la qualité des décisions et l'intégrité des données. Elle s'adresse aux biologistes en recherche qui pratiquent déjà le sujet et veulent l'articuler avec une méthode voisine ou une évolution récente, à partir de cas concrets et d'outils utilisables dès le retour au poste.
Programme en modules
Le programme de ce niveau 4 sur le thème CellProfiler est organisé en 4 modules, ajustés avec vous avant la session à partir de vos documents et de vos situations de travail. À l'issue de la session, les participants sont capables de mettre en œuvre chaque module dans leur contexte, sur un site pharmaceutique ou biotechnologique ou chez un prestataire du secteur.
Module 1 : Combiner CellProfiler avec ImageJ pour une analyse combinée
Pourquoi et quand : enjeux du sujet pour votre activité et exemples du secteur.
Module 2 : Analyser des images cellulaires avec CellProfiler
Apports et méthode, outils et pièges courants.
Module 3 : Automatiser le traitement d'images biologiques avec CellProfiler
Atelier sur un cas de votre organisation, traité en sous-groupes et restitué.
Module 4 : Maîtriser CellProfiler pour automatiser l'analyse d'images cellulaires
Synthèse, évaluation des acquis et plan d'actions.
Public, prérequis et durée
Public : praticiens du thème CellProfiler qui veulent combiner CellProfiler avec ImageJ pour une analyse combinée. Prérequis : niveau 2 acquis ou pratique régulière du sujet ; positionnement par questionnaire. Durée : 1 à 2 jours, modulables en demi-journées pour respecter les rotations d'équipes et les périodes de forte charge de production. Groupe : de quatre à dix participants, par niveau homogène, après positionnement par questionnaire.
Modalités et financement
La formation CellProfiler est délivrée sur mesure, en intra-entreprise, sur votre site, dans nos locaux à Lyon ou à distance en classe virtuelle pour les parties théoriques. La durée de cette formation est de 1 à 2 jours, modulable en demi-journées pour respecter les rotations d'équipes et les périodes de forte charge de production. Le programme définitif est établi avec vous à partir de vos objectifs, de vos documents et de vos situations de travail.
Nos actions de formation sont certifiées Qualiopi au titre des actions de formation et peuvent être financées par votre OPCO (opérateur de compétences). Chaque session se termine par une évaluation des acquis et une attestation détaillée, exploitable dans votre plan de développement des compétences et dans vos dossiers de formation. Elle n'est ni une habilitation ni une autorisation. Les formateurs sont des praticiens du secteur, tenus par les engagements de confidentialité demandés par le donneur d'ordre.
Déroulé d'une formation
Positionnement
Un court questionnaire situe chaque participant et permet de constituer des groupes homogènes.
Programme
Le programme est ajusté à vos objectifs, à vos documents et à vos cas lorsque la confidentialité le permet.
Session
En intra-entreprise, sur votre site, dans nos locaux à Lyon ou à distance pour les parties théoriques, par journées ou demi-journées.
Évaluation des acquis
Chaque session se termine par une évaluation et une attestation détaillée par participant.
Suite
Un bilan vous est remis, avec les compléments possibles et, lorsque le sujet le justifie, la liste des organismes compétents pour un titre ou une certification officielle.
Informations pratiques et réglementaires
- Objectifs pédagogiques
- Combiner CellProfiler avec ImageJ pour une analyse combinée
- Analyser des images cellulaires avec CellProfiler
- Automatiser le traitement d'images biologiques avec CellProfiler
- Maîtriser CellProfiler pour automatiser l'analyse d'images cellulaires
- Prérequis
- Niveau 2 acquis ou pratique régulière du sujet ; positionnement par questionnaire.
- Durée
- 1 à 2 jours, modulables en demi-journées
- Tarif
- À partir de 1 112 € HT par jour. Tarif ferme sur devis, selon le nombre de participants, le lieu et le niveau de personnalisation.
- Modalités et délais d'accès
- Un délai minimum de 7 jours est nécessaire pour accéder à cette formation. Toute inscription fait préalablement l'objet d'un devis et d'un entretien avec le formateur.
- Contact
- Romain Rissoan, responsable pédagogique, joignable par le formulaire de demande de devis de cette page ou au 09 72 65 24 84, du lundi au vendredi de 9 h à 18 h.
- Méthodes mobilisées, moyens et encadrement
- Formateur : Un praticien du secteur pharmaceutique et biotechnologique, dont les compétences sur le thème sont vérifiées avant chaque session.
- Méthodes pédagogiques : Expositive, démonstrative, interrogative, active ou de découverte et expérientielle, avec des cas construits tirés de la pharmacie, des biotechnologies et des dispositifs médicaux, sans donnée patient.
- Outils et moyens techniques : Vos supports et documents lorsque la confidentialité le permet, matériel de démonstration fourni par Optédif au besoin ; classe virtuelle pour les parties à distance.
- Support : Support de cours remis au format PDF en fin de formation.
- Encadrement : Le formateur vérifie les prérequis au démarrage, recueille les attentes des participants et valide leur progression.
- Modalités d'évaluation
- Positionnement initial par questionnaire ; évaluation des acquis en fin de session, par quiz ou mise en situation ; questionnaire de satisfaction à chaud ; attestation de fin de formation remise à chaque participant.
- Accessibilité aux personnes en situation de handicap
- La formation est accessible aux personnes en situation de handicap. Contactez notre référent handicap, Romain Rissoan, via le formulaire de devis ou au 09 72 65 24 84, pour tout besoin d'aménagement. Lors de votre demande de devis, vous pourrez préciser les besoins du participant. Notre politique d'accueil des personnes en situation de handicap
- Résultats
- Résultats de l'organisme Optédif Formation sur l'année 2025, tous sujets confondus : 99 % de satisfaction ; 506 personnes formées, plus 286 personnes confiées par un autre organisme de formation. Voir les avis
- Documents
- Conditions générales de vente, Règlement intérieur, Conditions générales d'utilisation, Politique de confidentialité.
- Certification et déclaration
- La certification qualité a été délivrée au titre de la catégorie d'action suivante : actions de formation. Déclaration d'activité enregistrée sous le numéro 82691159869 auprès du préfet de la région Auvergne-Rhône-Alpes. Cet enregistrement ne vaut pas agrément de l'État.
Information mise à jour le 2 novembre 2026
Questions fréquentes sur cette prestation
À qui s'adresse ce niveau 4 de la formation CellProfiler ?
Praticiens du thème CellProfiler qui veulent combiner CellProfiler avec ImageJ pour une analyse combinée. Niveau 2 acquis ou pratique régulière du sujet ; positionnement par questionnaire. La formation CellProfiler s'adresse en premier lieu aux profils suivants, chez les donneurs d'ordre comme chez leurs sous-traitants : biologistes en recherche, bioinformaticiens et techniciens de laboratoire. Le niveau 1 convient aux nouveaux entrants et aux personnes qui changent de périmètre : se familiariser avec les outils d'analyse d'images biologiques. Les niveaux 2 reprennent les bases (revoir la gestion des images cellulaires avec CellProfiler) ou accompagnent un changement d'outil ou de version (adapter la configuration d'un pipeline d'analyse à une nouvelle version de CellProfiler). Le niveau 3 est réservé aux praticiens confirmés qui veulent optimiser la segmentation des cellules dans CellProfiler.
Quelle durée et quel format pour ce niveau 4 de la formation CellProfiler ?
Ce niveau 4 dure 1 à 2 jours, modulables en demi-journées pour respecter les rotations d'équipes et les périodes de forte charge de production. Nous le délivrons en intra-entreprise, sur votre site, dans nos locaux à Lyon ou à distance en classe virtuelle pour les parties théoriques ; les mises en pratique restent en présentiel dès qu'elles exigent vos équipements ou vos documents. Un délai minimum de 7 jours est nécessaire pour accéder à cette formation. Toute inscription fait préalablement l'objet d'un devis et d'un entretien avec le formateur. Une attestation de fin de formation est remise à chaque participant.
Utilisez-vous nos données, ou des données de patients, pendant la formation ?
Non. Les exercices reposent sur des jeux de données publics ou synthétiques, en particulier pour les données génétiques, qui forment une catégorie particulière au sens du RGPD (règlement général sur la protection des données). Cette règle protège vos données de patients et vos secrets de procédé. Pour une mission d'audit, de conseil ou d'assistance sur le thème CellProfiler, la nature des données accessibles est fixée dès le devis, après un accord de confidentialité, selon le principe de minimisation : nous travaillons de préférence sur des extraits anonymisés ou synthétiques. Optédif ne traite pas de données de patients ni de données issues d'essais cliniques, et n'héberge aucune donnée de santé.
Demander un devis
Indiquez le site, les équipes concernées et l'échéance : nous vous répondons sous 48 h ouvrées ; le devis est établi après l'échange de cadrage.
Les autres déclinaisons de formation sur le thème CellProfiler
- Se familiariser avec les outils d'analyse d'images biologiques
- Revoir la gestion des images cellulaires avec CellProfiler
- Adapter la configuration d'un pipeline d'analyse à une nouvelle version de CellProfiler
- Optimiser la segmentation des cellules dans CellProfiler
- CellProfiler pour biologistes en recherche
- CellProfiler pour bioinformaticiens
- CellProfiler pour techniciens de laboratoire
- CellProfiler dans l'industrie biotechnologique
- CellProfiler dans la recherche pharmaceutique
- Gérer l'intégration de CellProfiler avec des outils de traitement d'images médicales
Les autres types de prestation sur le thème CellProfiler
- Revue de pipelines d'analyse, de scripts statistiques et de modèles (CellProfiler)
- Conseil en outils, architectures de données et cas d'usage IA (CellProfiler)
- Développement de pipelines bioinformatiques, d'analyses statistiques et d'assistants IA (CellProfiler)
- Accompagnement d'une équipe de recherche dans l'adoption de l'IA (CellProfiler)
- Assistance technique en biostatistique, bioinformatique et science des données (CellProfiler)






