PrestationDonnées, biostatistique et IARéf. formation-123662-niveau-3

FormationNiveau 3 : perfectionnement

Perfectionner la maîtrise des alignements complexes de séquences

Vos bioinformaticiens optimisent leurs pratiques, traitent les cas complexes et transmettent la méthode à leurs collègues.

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Image de synthèse : formateur en blouse devant un écran de schéma de cuve, stagiaires munis de tablettes
  • 2 à 3 jourscharge indicative
  • Forfaitformat
  • 7 jdémarrage

En bref

Résultat
Vos bioinformaticiens optimisent leurs pratiques, traitent les cas complexes et transmettent la méthode à leurs collègues.
Idéal pour
Praticiens confirmés et référents sur le thème BLAST (Basic Local Alignment Search Tool, outil de recherche d'alignement local de base) et alignement de séquences, appelés à traiter les cas difficiles et à former les autres.
Objectifs pédagogiques
Vous saurez : perfectionner la maîtrise des alignements complexes de séquences ; optimiser l'utilisation de BLAST pour des analyses à grande échelle ; se perfectionner dans l'interprétation des résultats d'alignement de séquences ; maîtriser BLAST pour analyser des séquences génétiques afin d'identifier des mutations ; combiner alignements de séquences et annotations pour des projets de génomique complète.
Livrables
Programme du niveau, support de session, évaluation des acquis et attestation détaillée par participant.
Prérequis
Niveau 2 acquis ou pratique régulière du sujet ; positionnement par questionnaire.
Durée
2 à 3 jours
Tarif
À partir de 1 112 € HT par jour.
Image de synthèse : formateur en blouse et gants montrant un montage de filtration à trois stagiaires masquées

Dans quelle situation

Un référent doit perfectionner la maîtrise des alignements complexes de séquences sur des cas complexes et répondre aux questions d'un client ou d'un auditeur. Le niveau 3 le prépare à argumenter ses choix et à transmettre la méthode.

Ce niveau de perfectionnement sur le thème BLAST et alignement de séquences s'adresse aux bioinformaticiens confirmés, dans les laboratoires de recherche et sur les sites industriels, où la fiabilité des analyses, la reproductibilité des résultats et l'encadrement des usages de l'IA engagent la qualité des décisions et l'intégrité des données. Il traite les cas complexes, les situations dégradées et les questions d'un client, d'un auditeur ou d'un inspecteur, puis prépare les participants à transmettre la méthode et à tenir le rôle de référent dans leur équipe.

Programme en modules

Le programme de ce niveau 3 sur le thème BLAST et alignement de séquences est organisé en 5 modules, ajustés avec vous avant la session à partir de vos documents et de vos situations de travail. À l'issue de la session, les participants sont capables de mettre en œuvre chaque module dans leur contexte, sur un site pharmaceutique ou biotechnologique ou chez un prestataire du secteur.

  1. Module 1 : Perfectionner la maîtrise des alignements complexes de séquences

    Cas complexes et situations dégradées, traités en sous-groupes et restitués.

  2. Module 2 : Optimiser l'utilisation de BLAST pour des analyses à grande échelle

    Optimisation des pratiques : gains de temps, de fiabilité et de traçabilité.

  3. Module 3 : Se perfectionner dans l'interprétation des résultats d'alignement de séquences

    Préparer et argumenter ses résultats devant un client, un auditeur ou un inspecteur.

  4. Module 4 : Maîtriser BLAST pour analyser des séquences génétiques afin d'identifier des mutations

    Transmettre : construire un support court et accompagner un collègue.

  5. Module 5 : Combiner alignements de séquences et annotations pour des projets de génomique complète

    Cas complexes et situations dégradées, traités en sous-groupes et restitués.

Public, prérequis et durée

Public : praticiens confirmés et référents sur le thème BLAST et alignement de séquences, appelés à traiter les cas difficiles et à former les autres. Prérequis : niveau 2 acquis ou pratique régulière du sujet ; positionnement par questionnaire. Durée : 2 à 3 jours, modulables en demi-journées pour respecter les rotations d'équipes et les périodes de forte charge de production. Groupe : de quatre à dix participants, par niveau homogène, après positionnement par questionnaire.

Modalités et financement

La formation BLAST et alignement de séquences est délivrée sur mesure, en intra-entreprise, sur votre site, dans nos locaux à Lyon ou à distance en classe virtuelle pour les parties théoriques. La durée de cette formation est de 2 à 3 jours, modulable en demi-journées pour respecter les rotations d'équipes et les périodes de forte charge de production. Le programme définitif est établi avec vous à partir de vos objectifs, de vos documents et de vos situations de travail.

Nos actions de formation sont certifiées Qualiopi au titre des actions de formation et peuvent être financées par votre OPCO (opérateur de compétences). Chaque session se termine par une évaluation des acquis et une attestation détaillée, exploitable dans votre plan de développement des compétences et dans vos dossiers de formation. Elle n'est ni une habilitation ni une autorisation. Les formateurs sont des praticiens du secteur, tenus par les engagements de confidentialité demandés par le donneur d'ordre.

Déroulé d'une formation

  1. Positionnement

    Un court questionnaire situe chaque participant et permet de constituer des groupes homogènes.

  2. Programme

    Le programme est ajusté à vos objectifs, à vos documents et à vos cas lorsque la confidentialité le permet.

  3. Session

    En intra-entreprise, sur votre site, dans nos locaux à Lyon ou à distance pour les parties théoriques, par journées ou demi-journées.

  4. Évaluation des acquis

    Chaque session se termine par une évaluation et une attestation détaillée par participant.

  5. Suite

    Un bilan vous est remis, avec les compléments possibles et, lorsque le sujet le justifie, la liste des organismes compétents pour un titre ou une certification officielle.

Informations pratiques et réglementaires

Objectifs pédagogiques
  • Perfectionner la maîtrise des alignements complexes de séquences
  • Optimiser l'utilisation de BLAST pour des analyses à grande échelle
  • Se perfectionner dans l'interprétation des résultats d'alignement de séquences
  • Maîtriser BLAST pour analyser des séquences génétiques afin d'identifier des mutations
  • Combiner alignements de séquences et annotations pour des projets de génomique complète
Prérequis
Niveau 2 acquis ou pratique régulière du sujet ; positionnement par questionnaire.
Durée
2 à 3 jours, modulables en demi-journées
Tarif
À partir de 1 112 € HT par jour. Tarif ferme sur devis, selon le nombre de participants, le lieu et le niveau de personnalisation.
Modalités et délais d'accès
Un délai minimum de 7 jours est nécessaire pour accéder à cette formation. Toute inscription fait préalablement l'objet d'un devis et d'un entretien avec le formateur.
Contact
Romain Rissoan, responsable pédagogique, joignable par le formulaire de demande de devis de cette page ou au 09 72 65 24 84, du lundi au vendredi de 9 h à 18 h.
Méthodes mobilisées, moyens et encadrement
  • Formateur : Un praticien du secteur pharmaceutique et biotechnologique, dont les compétences sur le thème sont vérifiées avant chaque session.
  • Méthodes pédagogiques : Expositive, démonstrative, interrogative, active ou de découverte et expérientielle, avec des cas construits tirés de la pharmacie, des biotechnologies et des dispositifs médicaux, sans donnée patient.
  • Outils et moyens techniques : Vos supports et documents lorsque la confidentialité le permet, matériel de démonstration fourni par Optédif au besoin ; classe virtuelle pour les parties à distance.
  • Support : Support de cours remis au format PDF en fin de formation.
  • Encadrement : Le formateur vérifie les prérequis au démarrage, recueille les attentes des participants et valide leur progression.
Modalités d'évaluation
Positionnement initial par questionnaire ; évaluation des acquis en fin de session, par quiz ou mise en situation ; questionnaire de satisfaction à chaud ; attestation de fin de formation remise à chaque participant.
Accessibilité aux personnes en situation de handicap
La formation est accessible aux personnes en situation de handicap. Contactez notre référent handicap, Romain Rissoan, via le formulaire de devis ou au 09 72 65 24 84, pour tout besoin d'aménagement. Lors de votre demande de devis, vous pourrez préciser les besoins du participant. Notre politique d'accueil des personnes en situation de handicap
Résultats
Résultats de l'organisme Optédif Formation sur l'année 2025, tous sujets confondus : 99 % de satisfaction ; 506 personnes formées, plus 286 personnes confiées par un autre organisme de formation. Voir les avis
Certification et déclaration
La certification qualité a été délivrée au titre de la catégorie d'action suivante : actions de formation. Déclaration d'activité enregistrée sous le numéro 82691159869 auprès du préfet de la région Auvergne-Rhône-Alpes. Cet enregistrement ne vaut pas agrément de l'État.

Information mise à jour le 2 novembre 2026

Questions fréquentes sur cette prestation

À qui s'adresse ce niveau 3 de la formation BLAST et alignement de séquences ?

Praticiens confirmés et référents sur le thème BLAST et alignement de séquences, appelés à traiter les cas difficiles et à former les autres. Niveau 2 acquis ou pratique régulière du sujet ; positionnement par questionnaire. La formation BLAST et alignement de séquences s'adresse en premier lieu aux profils suivants, chez les donneurs d'ordre comme chez leurs sous-traitants : chercheurs en génétique et bioinformaticiens. Le niveau 1 convient aux nouveaux entrants et aux personnes qui changent de périmètre : découvrir les principes fondamentaux du traitement des séquences génomiques. Les niveaux 2 reprennent les bases (revoir les méthodes d'alignement traditionnelles de séquences) ou accompagnent un changement d'outil ou de version (adapter l'alignement de séquences pour travailler avec de nouvelles versions de BLAST). Le niveau 3 est réservé aux praticiens confirmés qui veulent perfectionner la maîtrise des alignements complexes de séquences.

Quelle durée et quel format pour ce niveau 3 de la formation BLAST et alignement de séquences ?

Ce niveau 3 dure 2 à 3 jours, modulables en demi-journées pour respecter les rotations d'équipes et les périodes de forte charge de production. Nous le délivrons en intra-entreprise, sur votre site, dans nos locaux à Lyon ou à distance en classe virtuelle pour les parties théoriques ; les mises en pratique restent en présentiel dès qu'elles exigent vos équipements ou vos documents. Un délai minimum de 7 jours est nécessaire pour accéder à cette formation. Toute inscription fait préalablement l'objet d'un devis et d'un entretien avec le formateur. Une attestation de fin de formation est remise à chaque participant.

Utilisez-vous nos données, ou des données de patients, pendant la formation ?

Non. Les exercices reposent sur des jeux de données publics ou synthétiques, en particulier pour les données génétiques, qui forment une catégorie particulière au sens du RGPD (règlement général sur la protection des données). Cette règle protège vos données de patients et vos secrets de procédé. Pour une mission d'audit, de conseil ou d'assistance sur le thème BLAST et alignement de séquences, la nature des données accessibles est fixée dès le devis, après un accord de confidentialité, selon le principe de minimisation : nous travaillons de préférence sur des extraits anonymisés ou synthétiques. Optédif ne traite pas de données de patients ni de données issues d'essais cliniques, et n'héberge aucune donnée de santé.

Demander un devis

Indiquez le site, les équipes concernées et l'échéance : nous vous répondons sous 48 h ouvrées ; le devis est établi après l'échange de cadrage.

Réponse sous 48 h ouvrées. * Champs obligatoires.

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